[Pythontex] Problème de compilation

[zariski63]

Bonjour, j'aimerais savoir pourquoi mon code ne compile pas. J'ai deux codes python, séparément ça marche, ensemble ça ne marche plus...
Merci

Code : Tout sélectionner

\documentclass[12pt]{article}

\usepackage{fontspec}
\usepackage[tmargin=2cm,bmargin=2.5cm,hmargin=2cm]{geometry}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{comment}
\usepackage{pythontex}

\begin{document}

%\begin{comment}
\begin{pycode}
from matplotlib.pylab import *

x=arange(-pi,pi,0.05*pi)
plot(x,sin(x),'co',x,cos(x),'mD')
legend(['sinus','cosinus'],loc='upper left')
axis([-pi,pi,-1,1]); # axis([xmin,xmax,ymin,ymax])
savefig('courbe5.pdf',bbox_inches='tight')
\end{pycode}
\begin{center}
   \includegraphics[scale=1]{courbe5.pdf}
\end{center}
%\end{comment}

%\begin{comment}
\begin{pycode}
from matplotlib.pylab import *

x=linspace(5,6,100)
# Les listes des abscisses et ordonnées :
xx=[5.13 , 5.7, 5.48, 5.7, 5.66, 5.84, 5.5, 5.69, 5.44, 5.84, 5.82, 5.88, 5.61, 5.65, 5.21, 5.37, 5.46, 5.33, 5.15, 5.74]
yy=[19.47, 21.67, 20.98, 21.46 , 21.6, 22.29, 20.84, 21.46, 20.8, 21.56, 22.02 , 22.54, 21.2, 21.39, 20.49, 20.46, 20.72, 20.07 , 20.24, 21.6]
figure(figsize=(4,4), dpi=100)
a,b=polyfit(xx,yy,1)
plot(xx,yy,"o")
plot(x,a*x+b)
savefig('courbe6.pdf',bbox_inches='tight')
\end{pycode}
\begin{center}
   \includegraphics[scale=1]{courbe6.pdf}
\end{center}
%\end{comment}

\end{document}

[evariste_G]

Bonjour.

Vous ne précisez pas le mode de compilation.
De mon côté, je compile avec pdflatex.

Je compile une première fois pour générer les PDF (je commente donc les deux lignes \includegraphics) via pdflatex + pythontex, puis une seconde fois remettant les \includegraphics. Tout fonctionne bien:

temp.pdf

Pour ce genre de choses, je suggère l'utilisation de \IfFileExists:

Code : Tout sélectionner

\documentclass[12pt]{article}
\usepackage{fontspec}
\usepackage[tmargin=2cm,bmargin=2.5cm,hmargin=2cm]{geometry}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{pythontex}

\begin{document}

\begin{pycode}
from matplotlib.pylab import *

x=arange(-pi,pi,0.05*pi)
plot(x,sin(x),'co',x,cos(x),'mD')
legend(['sinus','cosinus'],loc='upper left')
axis([-pi,pi,-1,1]); # axis([xmin,xmax,ymin,ymax])
savefig('courbe5.pdf',bbox_inches='tight')
\end{pycode}
\begin{center}
\IfFileExists{courbe5.pdf}{\includegraphics[scale=1]{courbe5.pdf}}{}
\end{center}

\begin{pycode}
from matplotlib.pylab import *

x=linspace(5,6,100)
# Les listes des abscisses et ordonnées :
xx=[5.13 , 5.7, 5.48, 5.7, 5.66, 5.84, 5.5, 5.69, 5.44, 5.84, 5.82, 5.88, 5.61, 5.65, 5.21, 5.37, 5.46, 5.33, 5.15, 5.74]
yy=[19.47, 21.67, 20.98, 21.46 , 21.6, 22.29, 20.84, 21.46, 20.8, 21.56, 22.02 , 22.54, 21.2, 21.39, 20.49, 20.46, 20.72, 20.07 , 20.24, 21.6]
figure(figsize=(4,4), dpi=100)
a,b=polyfit(xx,yy,1)
plot(xx,yy,"o")
plot(x,a*x+b)
savefig('courbe6.pdf',bbox_inches='tight')
\end{pycode}
\begin{center}
\IfFileExists{courbe5.pdf}{\includegraphics[scale=1]{courbe6.pdf}}{}
\end{center}

\end{document}

et une compilation avec xelatex + pythontex + xelatex.

[zariski63]

oups...

Par lualatex puis pythontex et re- lualatex.

[zariski63]

Voici le message d'erreurs ...

Code : Tout sélectionner

Command Line:   pythontex.exe "Essais.tex"
Startup Folder: D:\MES DOCUMENTS\Documents temporaires\ESSAIS\Essais1

This is PythonTeX 0.17

----  Messages for py:default:default  ----
  Traceback (most recent call last):
* PythonTeX stderr - error on line 40:
    File "<outputdir>\py_default_default.py", line 77, in <module>
      a,b=polyfit(xx,yy,1)
    File "<__array_function__ internals>", line 5, in polyfit
    File "C:\Users\ERIC\AppData\Roaming\Python\Python38\site-packages\numpy\lib\polynomial.py", line 629, in polyfit
      c, resids, rank, s = lstsq(lhs, rhs, rcond)
    File "<__array_function__ internals>", line 5, in lstsq
    File "C:\Users\ERIC\AppData\Roaming\Python\Python38\site-packages\numpy\linalg\linalg.py", line 2306, in lstsq
      x, resids, rank, s = gufunc(a, b, rcond, signature=signature, extobj=extobj)
    File "C:\Users\ERIC\AppData\Roaming\Python\Python38\site-packages\numpy\linalg\linalg.py", line 100, in _raise_linalgerror_lstsq
      raise LinAlgError("SVD did not converge in Linear Least Squares")
  numpy.linalg.LinAlgError: SVD did not converge in Linear Least Squares

--------------------------------------------------
PythonTeX:  Essais - 1 error(s), 0 warning(s)

C:\texlive\2019\bin\win32\runscript.tlu:907: command failed with exit code 1:
python.exe c:\texlive\2019\texmf-dist\scripts\pythontex\pythontex.py "Essais.tex"

[evariste_G]

L'erreur semble provenir de l'installation TeXlive... Mais n'étant pas du tout expert en Texlive + Windows (perso, je suis sous MikTeX + Windows), je ne peux pas aider à résoudre ce problème.
Autant attendre l'avis d'un utilisateur de cette combinaison.

[zariski63]

Merci tout de même.

[conan]

Aucun problème avec le code proposé sous Linux+TexLive 2020.

[evariste_G]

À tout hasard, est-ce que Python est dans le PATH de windows ?

[zariski63]

Bien sûr. En fait j'ai 2 pythons.
- Un sur C:\EduPython version37 que je n'arrive pas à faire converser avec ma texlive2020 (réinstallée de puis hier).
- et un python39 dans mon C:\Users\... qui lui à priori converse avec ma texlive bien que je rencontre un souci avec pip, que j'essaie de régler tout
de suite ... Bref c'est galère ...

[marco56]

Aucun problème avec le code proposé sous Linux+TexLive 2020.

Moi, je n'obtiens pas les graphes.

[zariski63]

Compiler : pdflatex (ou lualatex) puis pythontex puis pdflatex (ou lualatex) mais j'imagine que vous l'avez fait ...

[marco56]

Compiler : pdflatex (ou lualatex) puis pythontex puis pdflatex (ou lualatex) mais j'imagine que vous l'avez fait ...

Oui.

[zariski63]

J'ai installé de nouveau python mais python37 car j'avais un soucis pour télécharger les modules avec python39 (trop récent surement).
Mais latex n'arrive toujours pas à compiler.
Voici le fichier d'erreurs :

Code : Tout sélectionner

Command Line:   pythontex.exe "Essais.tex"
Startup Folder: D:\MES DOCUMENTS\Documents temporaires\ESSAIS\Essais1

This is PythonTeX 0.17
Traceback (most recent call last):
  File "c:\texlive\2020\texmf-dist\scripts\pythontex\pythontex.py", line 62, in <module>
    pythontex.main()
  File "c:\texlive\2020\texmf-dist\scripts\pythontex\pythontex3.py", line 2796, in main
    get_old_data(data, old_data, temp_data)
  File "c:\texlive\2020\texmf-dist\scripts\pythontex\pythontex3.py", line 593, in get_old_data
    old = pickle.load(f)
ValueError: unsupported pickle protocol: 5
C:\texlive\2020\bin\win32\runscript.tlu:915: command failed with exit code 1:
python.exe c:\texlive\2020\texmf-dist\scripts\pythontex\pythontex.py "Essais.tex"

Moi j'y perds mon latin.

[zariski63]

Bon j'ai viré des fichiers d'anciennes compilations et miracle ça re-compile ... Apparemment cela semble résolu ...